體育科課程設計除了讓學生學習運動知識及技能外，更著重為學生建立健康的生活習慣。一至六年級每一個循環週均設有兩節體育科課，各級的教學內容是以螺旋式設計，同一運動項目由淺入深循序漸進地教授，而且會定期進行測試以作評估。另外，為增強學生體能和耐力，在設計體育課時，也會加入適量體適能練習，學生亦可透過參與不同的體適能活動，如仰臥起坐和耐力單車比賽等鍛鍊體魄。而評估內容包含知識、態度和技能三個範疇

為了培養學生勤做運動的良好習慣，營造校園普及運動的氣氛，本校會透過早操、開放校園計劃、校隊示範表演、體藝擂台、自學網站等多元化活動，讓學生了解運動的好處，加强學生的體育常識。除此之外，本校設置四至六年級的「體藝傑出表現獎」，以表揚在體育範疇中有出色表現的學生，藉此增加學生歸屬感和自信心。

為提升學生的技術和團隊的合作精神，本校設有田徑、羽毛球、排球、足球、籃球、乒乓球、舞蹈及花式跳繩等校隊訓練班，供學生作全年度有系統的訓練，而羽毛球運動更列為本校精英運動之一。本校校隊課程著重提升學生對該運動的認識及技術水平，透過階梯培訓計劃，老師發掘具潛質的學生作重點培訓，透過參與不同的比賽發揮學生潛能。歷年來，馬循學生在學界賽事中屢獲佳績。

體育科評估內容包含知識、態度和技能三個範疇：

  1. 知識:透過工作紙、壁報、外間團體到校示範等活動，提高學生對體育方面的知識。

  2. 技能:在課堂中，加強學生的體能訓練，而每學年於每級課堂中均推廣最少一項專項體育活動，提供對學生體育方面的技巧訓練，並提高學生的安全意識。

  • 一年級 韻律活動

  • 二年級 身體操控

  • 三年級 用具操控

  • 四年級 羽毛球 / 足球

  • 五年級 排球 / 乒乓球

  • 六年級 籃球 / 手球

3. 態度:透過課堂進行分組活動或隊際比賽，培養學生公平、公正及尊重別人的態度，讓學生發揮體育 的精神。